Python Module Index

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igf_data
    igf_data.igfdb.baseadaptor
    igf_data.igfdb.collectionadaptor
    igf_data.igfdb.experimentadaptor
    igf_data.igfdb.fileadaptor
    igf_data.igfdb.igfTables
    igf_data.igfdb.pipelineadaptor
    igf_data.igfdb.platformadaptor
    igf_data.igfdb.projectadaptor
    igf_data.igfdb.runadaptor
    igf_data.igfdb.sampleadaptor
    igf_data.igfdb.seqrunadaptor
    igf_data.igfdb.useradaptor
    igf_data.illumina.basesMask
    igf_data.illumina.runinfo_xml
    igf_data.illumina.runparameters_xml
    igf_data.illumina.samplesheet
    igf_data.process.metadata.experiment_metadata_updator
    igf_data.process.moveBclFilesForDemultiplexing
    igf_data.process.pipeline.modify_pipeline_seed
    igf_data.process.seqrun_processing.collect_seqrun_fastq_to_db
    igf_data.process.seqrun_processing.find_and_process_new_seqrun
    igf_data.process.seqrun_processing.find_and_register_new_project_data
    igf_data.process.seqrun_processing.reset_samplesheet_md5
    igf_data.process.singlecell_seqrun.mergesinglecellfastq
    igf_data.process.singlecell_seqrun.processsinglecellsamplesheet
    igf_data.utils.analysis_fastq_fetch_utils
    igf_data.utils.config_genome_browser
    igf_data.utils.dbutils
    igf_data.utils.disk_usage_utils
    igf_data.utils.ehive_utils.pipeseedfactory_utils
    igf_data.utils.fastq_utils
    igf_data.utils.fastqc_utils
    igf_data.utils.fileutils
    igf_data.utils.gviz_utils
    igf_data.utils.igf_irods_client
    igf_data.utils.pipelineutils
    igf_data.utils.platformutils
    igf_data.utils.project_analysis_utils
    igf_data.utils.project_data_display_utils
    igf_data.utils.project_status_utils
    igf_data.utils.projectutils
    igf_data.utils.seqrunutils
    igf_data.utils.sequtils
    igf_data.utils.tools.bwa_utils
    igf_data.utils.tools.cellranger.cellranger_count_utils
    igf_data.utils.tools.fastp_utils
    igf_data.utils.tools.gatk_utils
    igf_data.utils.tools.picard_util
    igf_data.utils.tools.reference_genome_utils
    igf_data.utils.tools.rsem_utils
    igf_data.utils.tools.samtools_utils
    igf_data.utils.tools.star_utils
    igf_data.utils.tools.subread_utils
    igf_data.utils.validation_check.metadata_validation